Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM6SF2Q9BZW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TM6SF2Q9BZW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM6SF2Q9BZW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms