Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRNKL1Q9BZJ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRNKL1Q9BZJ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRNKL1Q9BZJ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms