Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
UPF3BQ9BZI7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UPF3BQ9BZI7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UPF3BQ9BZI7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UPF3BQ9BZI7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms