Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTNAP3Q9BZ76 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms