Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A5Q9BY07 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC4A5Q9BY07 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A5Q9BY07 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms