Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDCA4Q9BXL8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDCA4Q9BXL8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDCA4Q9BXL8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms