Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SF3B5Q9BWJ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SF3B5Q9BWJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms