Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDUFAF3Q9BU61 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFAF3Q9BU61 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms