Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NDFIP1Q9BT67 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDFIP1Q9BT67 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDFIP1Q9BT67 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDFIP1Q9BT67 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDFIP1Q9BT67 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDFIP1Q9BT67 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDFIP1Q9BT67 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDFIP1Q9BT67 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDFIP1Q9BT67 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDFIP1Q9BT67 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms