Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR0

ZKSCAN3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3Q9BRR0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZKSCAN3Q9BRR0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZKSCAN3Q9BRR0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZKSCAN3Q9BRR0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms