Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CPPED1Q9BRF8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPPED1Q9BRF8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPPED1Q9BRF8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms