Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBA1CQ9BQE3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1CQ9BQE3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms