Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHDC3Q9BQ90 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC3Q9BQ90 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms