Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM7Q9BQ49 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM7Q9BQ49 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM7Q9BQ49 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM7Q9BQ49 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM7Q9BQ49 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM7Q9BQ49 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM7Q9BQ49 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM7Q9BQ49 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM7Q9BQ49 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM7Q9BQ49 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM7Q9BQ49 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM7Q9BQ49 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM7Q9BQ49 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms