Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms