Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARID3AQ99856 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARID3AQ99856 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3AQ99856 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms