Protein–RNA interactions for Protein: Q99808

SLC29A1, Equilibrative nucleoside transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A1Q99808 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A1Q99808 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC29A1Q99808 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC29A1Q99808 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms