Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS1Q99742 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPAS1Q99742 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPAS1Q99742 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms