Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIGMAR1Q99720 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms