Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELF4Q99607 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms