Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
LMTK3Q96Q04 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
LMTK3Q96Q04 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
LMTK3Q96Q04 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
LMTK3Q96Q04 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms