Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00479Q96M42 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00479Q96M42 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms