Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM47Q96LD4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms