Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPNQ96H22 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPNQ96H22 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms