Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCN3Q96D15 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RCN3Q96D15 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCN3Q96D15 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCN3Q96D15 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms