Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF501Q96CX3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF501Q96CX3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF501Q96CX3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms