Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTHRC1Q96CG8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTHRC1Q96CG8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms