Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDF1Q96CC6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDF1Q96CC6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDF1Q96CC6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms