Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RUNDC1Q96C34 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RUNDC1Q96C34 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms