Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EME1Q96AY2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EME1Q96AY2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms