Protein–RNA interactions for Protein: Q96A28

SLAMF9, SLAM family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF9Q96A28 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLAMF9Q96A28 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLAMF9Q96A28 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLAMF9Q96A28 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms