Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPTSSAQ969W0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms