Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA10Q969M2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA10Q969M2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms