Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF34Q969K3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF34Q969K3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF34Q969K3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms