Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-CQ95604 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-CQ95604 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-CQ95604 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-CQ95604 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms