Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HGDQ93099 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HGDQ93099 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HGDQ93099 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HGDQ93099 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HGDQ93099 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HGDQ93099 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HGDQ93099 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HGDQ93099 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HGDQ93099 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HGDQ93099 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HGDQ93099 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HGDQ93099 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HGDQ93099 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HGDQ93099 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HGDQ93099 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HGDQ93099 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HGDQ93099 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HGDQ93099 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HGDQ93099 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HGDQ93099 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HGDQ93099 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HGDQ93099 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HGDQ93099 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HGDQ93099 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HGDQ93099 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HGDQ93099 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HGDQ93099 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HGDQ93099 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HGDQ93099 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HGDQ93099 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HGDQ93099 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HGDQ93099 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HGDQ93099 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HGDQ93099 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HGDQ93099 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HGDQ93099 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HGDQ93099 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HGDQ93099 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HGDQ93099 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HGDQ93099 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HGDQ93099 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HGDQ93099 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HGDQ93099 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HGDQ93099 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HGDQ93099 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HGDQ93099 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HGDQ93099 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HGDQ93099 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HGDQ93099 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HGDQ93099 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HGDQ93099 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HGDQ93099 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HGDQ93099 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HGDQ93099 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HGDQ93099 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HGDQ93099 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HGDQ93099 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HGDQ93099 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HGDQ93099 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HGDQ93099 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HGDQ93099 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HGDQ93099 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HGDQ93099 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HGDQ93099 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HGDQ93099 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HGDQ93099 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HGDQ93099 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HGDQ93099 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HGDQ93099 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HGDQ93099 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HGDQ93099 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HGDQ93099 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HGDQ93099 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HGDQ93099 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HGDQ93099 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HGDQ93099 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HGDQ93099 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HGDQ93099 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HGDQ93099 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HGDQ93099 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HGDQ93099 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HGDQ93099 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HGDQ93099 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HGDQ93099 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HGDQ93099 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HGDQ93099 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HGDQ93099 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms