Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DPF3Q92784 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DPF3Q92784 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DPF3Q92784 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DPF3Q92784 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms