Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF3AQ92664 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3AQ92664 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms