Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNOT9Q92600 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNOT9Q92600 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNOT9Q92600 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNOT9Q92600 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT9Q92600 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT9Q92600 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms