Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMPDL3AQ92484 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMPDL3AQ92484 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPDL3AQ92484 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms