Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBLCP1Q8WVY7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBLCP1Q8WVY7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms