Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD30

GPT2, Alanine aminotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPT2Q8TD30 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPT2Q8TD30 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPT2Q8TD30 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPT2Q8TD30 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPT2Q8TD30 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPT2Q8TD30 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms