Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR5

CIRBP-AS1, Putative uncharacterized protein CIRBP-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-AS1Q8TBR5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIRBP-AS1Q8TBR5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CIRBP-AS1Q8TBR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms