Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SETD9Q8NE22 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SETD9Q8NE22 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD9Q8NE22 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms