Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BHLHE23Q8NDY6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BHLHE23Q8NDY6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms