Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC191Q8NCU4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC191Q8NCU4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC191Q8NCU4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms