Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM229BQ8NBD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM229BQ8NBD8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms