Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTUD6BQ8N6M0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD6BQ8N6M0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms