Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMTC2Q8N394 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TMTC2Q8N394 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMTC2Q8N394 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms