Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
VWDEQ8N2E2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
VWDEQ8N2E2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
VWDEQ8N2E2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
VWDEQ8N2E2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms